تُدفع الرسوم الدراسية في جامعة قطر في بداية كل فصل دراسي (الخريف، والربيع، والصيف) ويُطلب من الطلاب دفع جميع المبالغ المستحقة عن الفصل الحالي قبل التقديم في أي فصل دراسي قادم.
ويمكن دفع الرسوم نقدا أو بشيكات (بالنسبة للمؤسسات) في مكتب الخزانة بالإدارة المالية (الكائن في مبنى الأنشطة الطلابية)، أو عبر الانترنت من خلال نظام الدفع الإلكتروني باستخدام بطاقات الماستر كارد والفيزا كارد.
ويمكن للطلاب الاطلاع على الجداول التفصيلية التي توضح رسوم جميع التخصصات الدراسية في جامعة قطر من على الموقع الإلكتروني للجامعة .